En diciembre de 2014, siendo presidente de la República Enrique Peña Nieto, la Secretaría de Gobernación ordenó una reunión del Comité Técnico del Fideicomiso para el Cumplimiento de Obligaciones En Materia de Derechos Humanos a Cargo de Lía Limón en sus funciones como Subsecretaria de Derechos Humanos de Segob.
En dicha reunión Lía Limón ordenó de manera expresa que «se abriera la chequera» para resarcir los daños causados a los padres de los 43 normalistas desaparecidos y asesinados en Ayotzinapa, Guerrero.
Lía Limón fue ordenada por Enrique Peña Nieto a resolver las controversias con los padres de los normalistas para poder presentar ante el mundo supuestos avances sobre el caso.
Lía Limón enfrentó críticas bastante duras por la comunidad internacional en la Comisión Interamericana de Derechos Humanos en Washington el 30 de octubre y en la Corte Interamericana de Derechos Humanos el 21 de noviembre del mismo año.
